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illumina二代測序儀

更新時(shí)間:2022-06-12

簡要描述:

illumina二代測序儀MiSeq系統(tǒng)可通過各種測序應(yīng)用為您的研究提供便利進一步推進。它能夠自動(dòng)生成雙端read組合運用,每次運(yùn)行的產(chǎn)出高達(dá)15 Gb相對簡便,每條read可提供600多個(gè)堿基的測序數(shù)據(jù)。它使用的文庫制備試劑盒已針對多種應(yīng)用進(jìn)行了優(yōu)化臺上與臺下,包括靶向基因測序資料、小型基因組測序逐步顯現、擴(kuò)增子測序服務、16S宏基因組學(xué)等。

Illumina公司推出MiSeq是一臺在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測序和數(shù)據(jù)分析的新款測序儀通過活化,每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過1Gb的數(shù)據(jù)落地生根,且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準(zhǔn)確性健康發展,讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)的遺傳分析的理想平臺有效保障,適合廣泛的應(yīng)用。同時(shí)Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認(rèn)證長效機製,12年10月講實踐,MiSeq系統(tǒng)的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個(gè)方面完成奮戰不懈,一個(gè)是cluster密度的增大市場開拓,升級后cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至30-34million大大縮短;另一方面是通過測序讀長而提升通量要落實好,測序讀長達(dá)到2*300bp,同時(shí)測序速度也有所提升越來越重要的位置。目前新技術,Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測序300bp讀長共同學習,Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序順滑地配合。而這些,都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的效高。


MiSeq性能參數(shù)


Illumina MiSeq測序時(shí)間和數(shù)據(jù)量


讀長(bp)時(shí)間總數(shù)據(jù)量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



Illumina MiSeq讀取量比對


運(yùn)行類型通過過濾的讀惹把丶夹g。ò偃f)
升級前升級后
單端讀取5-7 M15-17 M
末端配對讀取10-14 M30-34 M


工作流程


illumina二代測序儀 MiSeq四大特性

1、較短的實(shí)驗(yàn)周期:從樣品制備開始需要8小時(shí)即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。

2多種方式、便捷的樣品制備流程:需50ngDNA模板對外開放,2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。

3深入交流研討、測序原理:MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理資料。

4、完整的整合功能:MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成實現了超越,雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作新產品,讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。


illumina二代測序儀 MiSeq應(yīng)用范圍

1橋梁作用、轉(zhuǎn)錄組測序

派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析平臺長遠所需。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析讓人糾結。


2規模、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序

對16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測序,鑒定細(xì)菌群和古生菌群基石之一。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定聯動。


3、Small RNA測序

1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度模樣,速度快生產體系,靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序很重要。


4能力和水平、重測序:包括全基因組重測序、簡化基因組測序異常狀況、外顯子測序研究。

Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序,每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測序應用創新。2011年12月27日提高,派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍的特性,比對至參考序列交流,基因組實(shí)現(xiàn)全覆蓋,同時(shí)檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異提供堅實支撐,包括插入還不大、缺失和SNP位點(diǎn),并且檢測到了全部質(zhì)粒信息化技術。


數(shù)據(jù)展示

* 以上產(chǎn)品介紹及數(shù)據(jù)來源于Illumina發揮作用,僅供參考良好,以Illumina為準(zhǔn)。



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